يمكن أن يمنع Bifidobacterium بشكل فعال البكتيريا الشائعة وبكتيريا درجة الحرارة المنخفضة-. يكون تأثيره المضاد للبكتيريا أساسًا من خلال منافسة مواقع التغذية والالتصاق ، وإنتاج المواد المضادة للبكتيريا ، وتعزيز مناعة الجسم. له تأثير على التصاق وتكاثر البكتيريا المسببة للأمراض المعوية. إلى العداء وحظر التسبب في المرض. المواد المضادة للبكتيريا التي تنتجها البكتيريا البكتيرية هي بشكل أساسي الأحماض العضوية والبكتيريا والبكتيريا والمواد المضادة للبكتيريا.
تزيد الأحماض الدهنية القصيرة المتطايرة - مثل حمض اللبنيك وحمض الأسيتيك ، والتي هي المستقلبات من البكتيريا البكتيرية ، من تركيز أيونات الهيدروجين في البيئة ، وهو أعلى من تركيز أيونات الهيدروجين في خلايا البكتيريا المسببة للأمراض. تخترق أيونات الهيدروجين خلايا البكتيريا المسببة للأمراض لجعلها تحمض السيتوبلازم يؤثر على نموها وحتى تعطيل البكتيريا المسببة للأمراض لتحقيق تأثيرات مضادة للبكتيريا.
أظهرت الدراسات أن مرق تخمير البكتيريا Bifidobacteria له تأثير واضح مضاد للبكتيريا في المختبر ، وأن درجة الحموضة المنخفضة هي حالة مهمة لتأثيرها المضاد للبكتيريا. بالإضافة إلى ذلك ، يمكن لبعض البكتيريا البكتيرية استقلابها لإنتاج بروتين تم تصنيعه بواسطة الريبوسومات ذات التأثيرات المضادة للبكتيريا ، والتي تسمى السموم البكتيرية ، والتي يمكن أن تمنع نمو البكتيريا المسببة للأمراض الأخرى.